Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BBS9Q3SYG4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BBS9Q3SYG4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms