Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPEL1Q2QD12 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms