Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIDA1Q1XH10 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIDA1Q1XH10 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIDA1Q1XH10 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms