Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q1T7F1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q1T7F1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q1T7F1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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