Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSPP1Q1MSJ5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms