Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GEN1Q17RS7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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