Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCK2Q16822 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCK2Q16822 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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