Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B3Q16720 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
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