Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HIST3H3Q16695 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIST3H3Q16695 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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