Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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CRY1Q16526 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRY1Q16526 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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CRY1Q16526 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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CRY1Q16526 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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CRY1Q16526 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CRY1Q16526 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CRY1Q16526 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CRY1Q16526 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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CRY1Q16526 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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CRY1Q16526 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
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