Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNA6Q15825 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNA6Q15825 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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