Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
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NCOA1Q15788 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NCOA1Q15788 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
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NCOA1Q15788 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
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NCOA1Q15788 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
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