Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIP13Q15645 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIP13Q15645 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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