Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF1Q15637 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF1Q15637 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF1Q15637 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF1Q15637 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF1Q15637 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SF1Q15637 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SF1Q15637 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF1Q15637 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF1Q15637 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF1Q15637 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF1Q15637 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF1Q15637 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF1Q15637 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF1Q15637 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF1Q15637 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF1Q15637 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF1Q15637 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF1Q15637 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF1Q15637 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF1Q15637 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF1Q15637 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF1Q15637 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF1Q15637 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF1Q15637 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF1Q15637 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF1Q15637 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF1Q15637 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF1Q15637 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF1Q15637 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF1Q15637 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF1Q15637 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF1Q15637 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF1Q15637 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF1Q15637 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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