Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYTH1Q15438 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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