Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR6A1Q15406 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR6A1Q15406 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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