Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTF1Q15361 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTF1Q15361 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
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