Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1I3Q14994 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms