Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN2CQ14957 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN2CQ14957 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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