Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IRF3Q14653 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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