Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3AQ14563 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3AQ14563 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms