Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BECN1Q14457 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
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