Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CSHL1Q14406 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CSHL1Q14406 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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