Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERV3-1Q14264 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERV3-1Q14264 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERV3-1Q14264 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERV3-1Q14264 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ERV3-1Q14264 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERV3-1Q14264 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERV3-1Q14264 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ERV3-1Q14264 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERV3-1Q14264 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERV3-1Q14264 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERV3-1Q14264 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERV3-1Q14264 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERV3-1Q14264 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ERV3-1Q14264 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERV3-1Q14264 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERV3-1Q14264 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERV3-1Q14264 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms