Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM25Q14258 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRIM25Q14258 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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