Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNC3Q14003 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNC3Q14003 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms