Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DDX39BQ13838 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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