Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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