Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CUL4BQ13620 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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