Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBB3Q13509 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBB3Q13509 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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