Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP140Q13342 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP140Q13342 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP140Q13342 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP140Q13342 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP140Q13342 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP140Q13342 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP140Q13342 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP140Q13342 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP140Q13342 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP140Q13342 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP140Q13342 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP140Q13342 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP140Q13342 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP140Q13342 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP140Q13342 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP140Q13342 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP140Q13342 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP140Q13342 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SP140Q13342 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SP140Q13342 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SP140Q13342 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SP140Q13342 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SP140Q13342 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SP140Q13342 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SP140Q13342 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SP140Q13342 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SP140Q13342 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SP140Q13342 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP140Q13342 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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SP140Q13342 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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SP140Q13342 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SP140Q13342 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SP140Q13342 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SP140Q13342 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SP140Q13342 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SP140Q13342 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SP140Q13342 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SP140Q13342 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SP140Q13342 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SP140Q13342 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SP140Q13342 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SP140Q13342 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SP140Q13342 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SP140Q13342 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SP140Q13342 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SP140Q13342 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SP140Q13342 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SP140Q13342 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SP140Q13342 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SP140Q13342 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SP140Q13342 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SP140Q13342 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SP140Q13342 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SP140Q13342 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SP140Q13342 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SP140Q13342 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SP140Q13342 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SP140Q13342 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SP140Q13342 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SP140Q13342 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
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