Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SRSF5Q13243 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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