Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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ERCC8Q13216 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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ERCC8Q13216 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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ERCC8Q13216 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERCC8Q13216 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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