Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALCOCO2Q13137 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALCOCO2Q13137 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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