Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR1H3Q13133 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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