Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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TRAF3Q13114 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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TRAF3Q13114 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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TRAF3Q13114 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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TRAF3Q13114 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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TRAF3Q13114 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF3Q13114 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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TRAF3Q13114 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
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TRAF3Q13114 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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TRAF3Q13114 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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TRAF3Q13114 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF3Q13114 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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