Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NPRL3Q12980 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NPRL3Q12980 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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