Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHD3Q12873 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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