Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMARCB1Q12824 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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