Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 PRM8YGL053W 714 nt3.44□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 BRR6YGL247W 594 nt3.44□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 COX2Q0250 756 nt3.44□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 VPS63YLR261C 327 nt3.44□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 RPL6BYLR448W 531 nt3.44□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 ERG2YMR202W 669 nt3.44□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YNL150WYNL150W 408 nt3.44□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 INN1YNL152W 1230 nt3.44□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 RPL18AYOL120C 561 nt3.44□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 SRL1YOR247W 633 nt3.44□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 snR35snR35 204 nt3.44□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 VHR1YIL056W 1923 nt3.44□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 FUN12YAL035W 3009 nt3.44□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 CAF130YGR134W 3369 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 PHR1YOR386W 1698 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YOR296WYOR296W 3870 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YNR063WYNR063W 1824 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 CBS1YDL069C 690 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YDR115WYDR115W 318 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YDR262WYDR262W 819 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 VMA10YHR039C-A 345 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YHR213WYHR213W 597 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YIL141WYIL141W 390 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 RPA12YJR063W 378 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 PBA1YLR199C 831 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YAR062WYAR062W 597 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 ARG80YMR042W 534 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 MBA1YBR185C 837 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 ALG8YOR067C 1734 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 GSC2YGR032W 5688 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 REB1YBR049C 2433 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 SLK19YOR195W 2466 nt3.43□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 BEM4YPL161C 1902 nt3.42□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 MCD4YKL165C 2760 nt3.42□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 NSA1YGL111W 1392 nt3.42□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 HTA1YDR225W 399 nt3.42□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 VMA8YEL051W 771 nt3.42□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YJR037WYJR037W 384 nt3.42□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 SYM1YLR251W 594 nt3.42□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YLR252WYLR252W 306 nt3.42□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 BER1YLR412W 825 nt3.42□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 PHO80YOL001W 882 nt3.42□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 CSI2YOL007C 1026 nt3.42□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 SCD6YPR129W 1050 nt3.42□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 FLO10YKR102W 3510 nt3.42□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YKL050CYKL050C 2769 nt3.41□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.41□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 RPL16AYIL133C 600 nt3.41□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt3.41□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 TPK2YPL203W 1143 nt3.41□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 RPN3YER021W 1572 nt3.41□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 SNU56YDR240C 1479 nt3.41□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 SKO1YNL167C 1944 nt3.4□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YRM1YOR172W 2361 nt3.4□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 ALA1YOR335C 2877 nt3.4□□□□□ -1.86
LCB4Q12246 YGL039WYGL039W 1047 nt3.4□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 CSE4YKL049C 690 nt3.4□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YHC1YLR298C 696 nt3.4□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 RPS16AYMR143W 432 nt3.4□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YNL089CYNL089C 477 nt3.4□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YNL184CYNL184C 327 nt3.4□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 GCY1YOR120W 939 nt3.4□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt3.4□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 NUP60YAR002W 1620 nt3.4□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 PCI8YIL071C 1335 nt3.4□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 GAL80YML051W 1308 nt3.4□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 MTR4YJL050W 3222 nt3.4□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 ITT1YML068W 1395 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 KIP3YGL216W 2418 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 FMN1YDR236C 657 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 CHZ1YER030W 462 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YHL026CYHL026C 948 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 PCL5YHR071W 690 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YAL004WYAL004W 648 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 RPC37YKR025W 849 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 ATG21YPL100W 1491 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 STE23YLR389C 3084 nt3.39□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 ASM4YDL088C 1587 nt3.38□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YDR250CYDR250C 276 nt3.38□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 GIM4YEL003W 336 nt3.38□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 SPT4YGR063C 309 nt3.38□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YHR212CYHR212C 336 nt3.38□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 ACF4YJR083C 930 nt3.38□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YAR060CYAR060C 336 nt3.38□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 PRM3YPL192C 402 nt3.38□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 TMA64YDR117C 1698 nt3.38□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 GDS1YOR355W 1569 nt3.38□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 SPO23YBR250W 1572 nt3.38□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YLR352WYLR352W 2424 nt3.38□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 ERB1YMR049C 2424 nt3.38□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 KRE5YOR336W 4098 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 VAC14YLR386W 2643 nt3.37□□□□□ -1.87
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