Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 MAC1YMR021C 1254 nt2.16□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YNL235CYNL235C 432 nt2.16□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 IST1YNL265C 897 nt2.16□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 YOR292CYOR292C 930 nt2.16□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 ISW2YOR304W 3363 nt2.16□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 PCK1YKR097W 1650 nt2.16□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 MIC60YKR016W 1623 nt2.16□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 FRQ1YDR373W 573 nt2.15□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 RNR4YGR180C 1038 nt2.15□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 HAL1YPR005C 885 nt2.15□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 NEL1YHR035W 1893 nt2.15□□□□□ -2.06
TY1B-BRQ12193 EAF5YEL018W 840 nt2.15□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 YER121WYER121W 345 nt2.15□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 COS6YGR295C 1146 nt2.15□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 YBL073WYBL073W 312 nt2.15□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 SYC1YOR179C 567 nt2.15□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 VMA9YCL005W-A 222 nt2.15□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 OSW5YMR148W 447 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 YNL035CYNL035C 1170 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 USO1YDL058W 5373 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 TOM70YNL121C 1854 nt2.14□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 TPO5YKL174C 1857 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 RGA2YDR379W 3030 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 TPM2YIL138C 486 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 PIS1YPR113W 663 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 NUP157YER105C 4176 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 HOS4YIL112W 3252 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 PEX5YDR244W 1839 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 SCL1YGL011C 759 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 RPS25AYGR027C 327 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 RPL20AYMR242C 519 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 SSN8YNL025C 972 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 CNS1YBR155W 1158 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 VPS54YDR027C 2670 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 YKU80YMR106C 1890 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 MCD1YDL003W 1701 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 YGR237CYGR237C 2358 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 UTP13YLR222C 2454 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 HPA3YEL066W 540 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 HRI1YLR301W 735 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 MPD2YOL088C 834 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 IBA57YJR122W 1494 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 SPS2YDR522C 1509 nt2.11□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.11□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 STP1YDR463W 1560 nt2.11□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 ELG1YOR144C 2376 nt2.11□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 REG1YDR028C 3045 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 PLC1YPL268W 2610 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 ERP3YDL018C 678 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 YGR111WYGR111W 1203 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 YKR047WYKR047W 306 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 YLR422WYLR422W 5799 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 ARG2YJL071W 1725 nt2.09□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 YCR099CYCR099C 468 nt2.09□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 YLR224WYLR224W 1110 nt2.09□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 YBR089WYBR089W 600 nt2.09□□□□□ -2.07
TY1B-BRQ12193 ATP25YMR098C 1839 nt2.09□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 KXD1YGL079W 657 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 SNL1YIL016W 480 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 YKL071WYKL071W 771 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 SEC3YER008C 4011 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 DSE4YNR067C 3354 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 INA22YIR024C 651 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 RPB11YOL005C 363 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 OCT1YKL134C 2319 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 ALB1YJL122W 528 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 NRG2YBR066C 663 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 APM1YPL259C 1428 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 RIC1YLR039C 3171 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 MRP10YDL045W-A 288 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 CTH1YDR151C 978 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 NDC80YIL144W 2076 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 SHE9YDR393W 1371 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 SEC15YGL233W 2733 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 DOP1YDR141C 5097 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 MRE11YMR224C 2079 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 MLP2YIL149C 5040 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 MDM32YOR147W 1869 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 UTP5YDR398W 1932 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 PHO5YBR093C 1404 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 COG2YGR120C 789 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 ERG29YMR134W 714 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 RNA1YMR235C 1224 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 UFD2YDL190C 2886 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 CNM67YNL225C 1746 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 ART10YLR392C 1557 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 SMP3YOR149C 1551 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 CIK1YMR198W 1785 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 AAR2YBL074C 1068 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 LHS1YKL073W 2646 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 SLM1YIL105C 2061 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 VPS15YBR097W 4365 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 ALE1YOR175C 1860 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1B-BRQ12193 YPR097WYPR097W 3222 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1B-BRQ12193 UTP20YBL004W 7482 nt2.02□□□□□ -2.09
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