Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC173Q0VFZ6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms