Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LMOD3Q0VAK6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms