Protein–RNA interactions for Protein: Q0GE19

SLC10A7, Sodium/bile acid cotransporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A7Q0GE19 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC10A7Q0GE19 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC10A7Q0GE19 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms