Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C2orf54Q08AI8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms