Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4CQ08493 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms