Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GOLGA3Q08378 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GOLGA3Q08378 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms