Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNB2Q08289 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNB2Q08289 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms