Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DHX9Q08211 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms