Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP3CAQ08209 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP3CAQ08209 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms